Controls de qualitat d'ADN al Biobanc HCB-IDIBAPS

Abstract

Des que a l’any 2008 s’inicià el Biobanc de l’Hospital Clínic de Barcelona - Institut d’Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (HCB-IDIBAPS), els procediments i els controls de qualitat de mostres d’ADN segueixen vigents. Degut als recents avenços científics, exposats en conferències i formacions nacionals i internacionals, s’ha fet evident la necessitat d’actualitzar-los i estandarditzar-los per continuar essent un Biobanc de referència. L’objectiu d’aquest estudi fou recol·lectar els controls de qualitat d’ADN més utilitzats a nivell nacional i internacional per tal de determinar els més àmpliament emprats i aplicar-los al Biobanc HCB-IDIBAPS. Per tal de dur a terme el projecte, es va dissenyar una enquesta per als biobancs que formen part de la Red Nacional de Biobancos i es va contactar amb l’Scottish HPV Archive, el Biobank Côte d’Azur i el Biobanco Nacional de ADN Carlos III. Els resultats preliminars obtinguts han permès actualitzar i estandarditzar els controls de qualitat al Biobanc HCB-IDIBAPS. Així doncs, s’ha establert la realització de controls de qualitat de l’ADN de processat per tal d’aplicar de forma continuada els protocols; controls previs a la cessió de mostres d’ADN, per tal de garantir-ne l’òptima qualitat quan se cedeixen per a estudis científics; i controls històrics, per tal d’assegurar la bona qualitat de l’ADN de les mostres emmagatzemades en llargs períodes de temps. Un cop l’enquesta sigui difosa i analitzada, permetrà determinar a nivell nacional els controls de qualitat més àmpliament utilitzats, la freqüència d’aquests i la mida mostral en què es duen a terme. Tanmateix, en aquest treball s’ha simulat la posada a punt d’una de les tècniques recents més instaurades pel que fa a la traçabilitat de mostres: la PCR de microsatèl·lits (seqüències curtes repetides en tàndem; STRs). Aquest control de qualitat s’utilitza quan se sospita que s’ha pogut perdre la traçabilitat de mostres que presenten el mateix sexe, ja que cada individu presenta un perfil clarament diferenciat. Finalment, tots els resultats obtinguts han permès l’actualització del procediment (PR) en què es regirà tot el personal del Biobanc HCB-IDIBAPS a l’hora de realitzar els controls de qualitat de l’ADN sota la norma ISO 9001:2015 i la seva adaptació a la ISO 20387:2018.

Since the establishment of the Hospital Clínic of Barcelona - Institut d’ Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer Biobank (HCB-IDIBAPS Biobank) on 2008, the DNA samples quality controls and procedures remain in effect. The recent scientific advances exposed in among national and international conferences and academic trainings have revealed the need to update and standardize the quality controls in order to continue being considered as a benchmark Biobank. The aim of the study was to gather the national and international DNA quality controls to determine the most widely used to implement some of them in HCB-IDIBAPS Biobank. In order to develop the project, we performed a survey to the biobanks from the Red Nacional de Biobancos. Likewise, we contacted to the Scottish HPV Archive, the Biobank Côte d’Azur and the Biobanco Nacional de DNA Carlos III. The preliminary results have allowed the update and the standardization of the DNA quality controls from HCB-IDIBAPS Biobank. Briefly, we have established DNA quality controls to assess the proper functionality of the processing protocols, DNA quality controls prior to sample transference to researchers to guarantee a high-quality material for scientific studies and “historic” DNA quality controls to verify the proper quality in long-term stored samples. The dissemination and analysis of the survey would provide, at the national level, the most widely employed DNA quality controls, the frequency in which there are performed and the sample size utilized. Moreover, in this project we have simulated the set-up of one of the most recent techniques established to determine the samples traceability: The microsatellites multiplex PCR (Short Tandem Repeats; STRs). This quality control can be performed when same-sex samples have lost their traceability, since every person possess a unique profile. Finally, all the obtained results have resulted in the update of the procedure (PR), in which all the the HCB-IDIBAPS Biobank staff will follow to perform the DNA quality controls under the ISO 9001: 2015 and its adaptation to the ISO 20387: 2018.