Bioinformatics tools for membrane proteins: from sequences to structure and function

Abstract

Membrane proteins are a large group of proteins that play an essential role in the cell. This group includes receptors, ion channels, transporters, and enzymes, which account for 25% of the proteins in the human genome. About 50% of membrane proteins are pharmacological targets for various diseases. In addition, there are pathogenic mutations that affect their folding, stability, and function for 90% of membrane proteins. Research on membrane proteins has grown in recent years. along with the development of computational tools to process sequence data, both structural and functional, have become essential to understanding all available information about these proteins. The main goal of this thesis is to develop bioinformatics tools to model and analyze membrane proteins.

Les proteïnes de membrana són un gran grup de proteïnes que tenen un paper essencial a la cèl·lula. Aquest grup inclou receptors, canals iònics, transportadors i enzims, que representen el 25% de les proteïnes del genoma humà. Al voltant del 50% de les proteïnes de membrana són dianes farmacològiques per a diverses malalties. A més, hi ha mutacions patògenes que afecten el seu plegament, estabilitat i funció per al 90% de les proteïnes de membrana. La investigació sobre proteïnes de membrana ha crescut al llarg dels darrers anys. juntament amb el desenvolupament d'eines computacionals per tractar dades de seqüències, estructurals i funcionals, s'han convertit en essencials per entendre tota la informació disponible sobre aquestes proteïnes. L'objectiu principal d'aquesta tesi és desenvolupar eines bioinformàtiques per modelar i analitzar proteïnes de membrana.